3D Interaction Viewer и база данных (3DIV) - это простая в использовании база данных, обеспечивающая эпигенетическую аннотацию, единую визуализацию взаимодействия хроматина в различных вариантах. Пространственное взаимодействие хроматина играет важную роль в регуляции генов, и визуализация и аннотирование этих взаимодействий является ключевым для связи между генетическим / эпигенетическим изменением и фенотипическим полиморфизмом. Например, взаимодействие энхансер-промотор необходимо для регуляции экспрессии гена-мишени. 3DIV обеспечивает следующий анализ; Идентификация и аннотация взаимодействия, визуализация интерактивного взаимодействия и сравнительная визуализация взаимодействия
Для более подробной информации, пожалуйста, нажмите Вот.
Сохранить настройки
Настройка загрузки
Используйте свои собственные данные
Выберите образец (ы)
- Дорсолатеральная префронтальная кора
- гиппокамп
- легкое
- печень
- Левый желудочек
- яичник
- поджелудочная железа
- поясничная мышца
- Правый желудочек
- Тонкая кишка
- селезенка
- тимус
- H1 Embroynic Stem Cell
- Ячейка мезендодермы, полученная из H1
- H1-производная мезенхимальная стволовая клетка
- Полученная из H1 нейрональная клетка-предшественник
- Трофэктодерма, полученная из H1
- H9 Эмбриональная стволовая клетка
- Нейроэктодермальные клетки, полученные из H9
- GM12878 Линия лимфобластных клеток
- IMR90 фибробласт, контроль
- IMR90 фибробласт, обработанный флбопиридолом
- IMR90 фибробласт, обработанный TNF-α
- Фибробласт (CRL-2522), контроль
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 00h
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 08ч
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 16ч
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 24ч
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 32 ч
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 40ч
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 48 ч
- Фибробласт (CRL-2522), дексаметазон 56ч
- Клеточная линия аденокарциномы (A549), дексаметазон 00h
- Клеточная линия аденокарциномы (A549), дексаметазон 01ч
- Клеточная линия аденокарциномы (A549), дексаметазон 04h
- Клеточная линия аденокарциномы (A549), дексаметазон 08ч
- Клеточная линия аденокарциномы (A549), дексаметазон 12ч
- Линия клеток рака простаты LNCap, BglII
- Клеточная линия рака предстательной железы PC3, BglII
- PrEC нормальная эпителиальная клетка простаты, BglII
- GM12878, разведение HiC, HindIII
- Раствор GM12878 HiC, NcoI
- GM12878, in situ HiC, DpnII
- GM12878, in situ HiC, NcoI
- GM12878, MboI на месте
- HMEC, in-situ MboI
- HUVEC, in-situ MboI
- IMR90, на месте MboI
- K562, на месте MboI
- KBM7, на месте MboI
- NHEK, на месте MboI
- Линия эпителиальных клеток простаты RWPE1, гиперэкспрессия ERG
- Линия эпителиальных клеток простаты RWPE1, контроль
- HEK293, лечение TEV
- HEK293, лечение HRV
- HEK293 миРНК-контроль
- HEK293 миРНК CTCF
- MCF-10A
- MCF-7
- MCF-10A, скрэббл шРНК
- MCF-10A, BRG1 шРНК
- MCF-7, неспецифическая шРНК
- MCF-7, RUNX1 шРНК
- A549 Cell Line
- Caki2 Cell Line
- G401 Cell Line
- NCI-H460 Cell Line
- Клеточная линия LNCaP
- Panc1 Cell Line
- RPMI-7951 Cell Line
- SK-MEL-5 Cell Line
- SK-N-DZ Cell Line
- SK-N-MC Cell Line
- T47D Cell Line
- эндотелиальная клетка печеночной синусоиды
- астроцит мозжечка
- Клеточная линия KBM7
Больше эксперимента ▼
TAD:
Предметы выбраны
Пример Run Run
Рекомендации
3DIV: средство просмотра 3D-генома и база данных Дунчан Ян, Инсу Джанг, Чинхюк Чой, Мин-Сео Ким, Эндрю Дж Ли, Хён Вонг Ким, Чонхён Эом, Донгсуп Ким, Инкьюнг Чунг и Бьюнгвук Ли
Nucleic Acids Res. 2018 янв; Том 46, выпуск D1 (выпуск базы данных): D52-57.